Als Matrixorganisation bezeichnet man eine funktionale Projektorganisation. Sie stellt die Kompetenz und Verantwortlichkeiten der Projektleiter und -mitarbeiter dar. In einer Matrixorganisation sind zwei Organisationsmöglichkeiten vertreten. Die Projektmitarbeiter sind mehreren Linienvorgesetzten unterstellt, wobei der Projektleiter aus dieser Linie herausgelöst ist. Alle Mitarbeiter werden für ein Projekt nur für eine bestimmte Zeit eingesetzt und sollen die Anweisungen sowohl vom Projektleiter als auch von den jeweiligen verrichtungsbezogenen Abteilungen und gleichzeitig den objektbezogenen Produktmanagern erhalten. Diese Arbeitsverhältnisse sind in Form der Mehrlinienorganisationen, in einer Matrixorganisation, organisiert.
Solche Überschneidungen der Zuständigkeiten und Weisungsbefugnisse führen häufig zu einem größeren Kommunikationsaufwand sowie zu unklaren Verantwortlichkeiten. Von Vorteil ist jedoch die größere Flexibilität der Mitarbeiter im Einsatz sowohl im Projekt als auch in der Linie; die Nutzung des Spezialistenwissens ohne Hindernisse; die Förderung des bereichs- und fachbereichsübergreifenden Denkens.